中国荷斯坦牛基因组选择技术平台的建立与应用
成果信息
项目年度编号: 1600060161
限制使用: 国内
省市: 北京
中图分类号: S823.2
成果类别: 基础研究
成果公布年份: 2015
关键词: 荷斯坦牛 遗传育种学 奶牛
成果简介: 该项目属于现代农业领域畜牧学、家畜遗传育种学科。奶牛育种是奶业发展的基础和关键,基因组选择技术已成为奶牛育种乃至畜禽育种的一项新的革命性分子育种技术。针对中国奶牛育种实际情况,建立了中国荷斯坦牛基因组选择技术平台,取得了重要成果,并在全国推广应用。主要技术创新点:提出了基因组育种值估计的一系列新方法(TA-BLUP、BayesTA、BayesTB和BayesTC),显著提高了其估计准确性;同时,为降低基因组选择的育种成本,提出了低密度芯片的设计和实施策略及基因型填充策略。丰富和完善了基因组选择的理论和方法,并为中国实施奶牛基因组选择提供了理论支撑。创建了中国奶牛基因组选择参考群,由6000头母牛和400头验证公牛组成,包括高密度SNP基因型数据和产奶、健康、体型、繁殖等4类34个性状的表型和育种值数据。为中国实施奶牛基因组选择奠定了基础。构建了以集群为核心的高性能计算平台,开发了SNP芯片数据处理软件和基因组育种值计算程序,建立了中国荷斯坦牛基因组选择数据库。为中国荷斯坦牛基因组选择研究与实施提供了关键和必要的技术。率先在中国利用高密度SNP芯片进行了产奶、健康和体型性状的大规模全基因组关联分析及转录组测序,首次在国际上报道了PTK2、EEF1D、UGDH等影响产奶性状的功能基因,开发了牛基因组SNP功能注释系统。对进一步提高基因组选择效率具有重要作用。根据中国奶牛育种的实际情况,首次提出了基因组信息和传统育种信息结合的基因组性能指数(GCPI),并制定了青年公牛基因组选择具体实施方案。应用推广及效益:该成果提出的基因组选择方案已被农业部正式采用,自2012年,连续3年累计为全国26个公牛站的1547头青年公牛进行了基因组遗传评估,选出724头优秀青年公牛进入国家良种补贴项目,其冷冻精液已在全国范围内推广,促进了优良基因的快速传递,缩短了世代间隔,降低了育种成本,显著提高了中国荷斯坦牛的遗传改良速度,经济效益达21.87亿元,具有重要的社会和生态效益。促进科技进步的作用:发表论文44篇,其中SCI收录35篇;获软件著作权13项、国家发明专利8项、申请发明专利3项、教育部科技成果1项。总体上,该成果的技术水平已达到发达国家同类技术的先进水平,在部分领域达到国际领先水平,不仅为中国奶牛育种实施基因组选择提供了技术平台,也为中国其他畜种应用基因组选择技术提供了借鉴,对在中国动物育种中全面应用基因组选择技术起到巨大的推动作用。
申报信息
推荐部门: 中国农业大学
登记号: I30-2015-004
相关人信息
完成单位: 中国农业大学 中国奶业协会 全国畜牧总站 北京奶牛中心 北京首农畜牧发展有限公司 上海奶牛育种中心有限公司
完成人: 张勤 张沅 张胜利 孙东晓 丁向东 刘林 李锡智 刘剑锋 刘海良 姜力 刘光磊 乔绿 王雅春 俞英 张毅
行业及专利信息
应用行业名称: 牲畜的饲养
应用行业码: 031
转让信息
投资信息
推广信息
联系信息
联系单位名称: 中国农业大学
联系单位地址: 北京市海淀区清华东路17号
传真: (010)62736902;62736870
邮政编码: 100083
电子邮件: support@cau.edu.cn;zsb@cau.edu.cn