菠萝NAC转录因子基因AcoNAC1生物信息学及表达分析
Bioinformatics and Expression Analysis of a NAC Transcription Fac-tor Gene AcoNAC1 in Ananas comosus
摘要
NAC转录因子作为植物中数量最大的转录因子家族之一,在植物生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要的调控作用.本研究以菠萝为试验材料,采用RT-PCR技术克隆得到基因AcoNAC1(GenBank登录号:XM_020225830),对其进行生物信息学及表达分析.生物信息学分析表明,该基因cDNA序列全长1723 bp,ORF为1062 bp,编码353个氨基酸,相对分子量为38.34 kDa,理论等电点为8.88;其编码蛋白的二级结构由20.40％的 α-螺旋(H)和15.30％的β-折叠(E)以及59.21％的无规则卷曲(C)组成,具有NAC典型结构保守域.基因表达分析表明,AcoNAC1基因的表达受低温和干旱胁迫诱导,低温胁迫24 h和干旱胁迫12 h时的表达量最高;在不同成熟期品种中表现出持续的诱导表达,但诱导强度逐渐下降,其中早熟品种谢花后20～50 d及晚熟品种谢花后20～60 d基因表达量均处于较高水平.因此,推测AcoNAC1基因可能参与菠萝逆境胁迫响应以及果实发育与成熟的调控.
Author：
TAN Qinliang
CAI Yuanbao
YANG Xiangyan
LI Mu
LI Jidong
HUANG Sijie
CHEN Qin
PANG Xinhua
ZHU Pengjin
ZHOU Quanguang
作者单位：
广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 530001
广西农垦甘蔗研究所,广西南宁 530001
年，卷(期)：
2021, 42(2)
分类号：
S668.3
机标分类号：
S512.1
S663.1
Q75
在线出版日期：
2021年3月24日
基金项目：
No.2019GXNSFAA245010:广西自然科学基金2020YM55;2021YT153:广西农科院基本科研业务费专项201903:广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费专项，
